Nie jesteś zalogowany |
Algorithmic challenges in mass spectrometry
- Prelegent(ci)
- Anna Gambin
- Język referatu
- angielski
- Termin
- 5 grudnia 2024 14:30
- Pokój
- p. 2180
- Tytuł w języku polskim
- Algorytmiczne wyzwania w spektrometrii mas
- Seminarium
- Kolokwium Wydziału MIM UW
W tym wystąpieniu przedstawiam serię powiązanych zagadnień związanych z modelowaniem danych spektrometrycznych. Prezentację rozpocznę omówieniem dwóch algorytmów do generowania rozkładów izotopowych (BRAIN i ISOSPEC).Następnie krótko poruszę problem modelowania fragmentacji cząsteczek, a na koniec przedstawię pomysł wykorzystania matematycznej teorii optymalnego transportu do dekonwolucji sygnału.
In this talk, I present a series of related topics in the mathematical modeling of mass spectrometry data. The presentation opens with a presentation of two algorithms for the generation of the isotopic structure (BRAIN and ISOSPEC). Then I briefly touch on the problem of understanding Electron Driven reactions, whose principal aim is to induce ion fragmentation. Here I apply the mathematical theory of reaction kinetics to estimate the reaction rates of the electron transfer reactions. Last but not least I present a breakthrough idea to use the mathematical theory of optimal transport for signal deconvolution.
