Modele ekspresji genów zawierających opóźnienia czasowe

Speaker(s)

Kamila Łyczek

Affiliation

Uniwersytet Warszawski

Date

June 7, 2013, 12:15 p.m.

Information about the event

3

Seminar

Seminar Mathematical Models of Gene Expression and Regulatory Networks

---

W analizowanych pracach proces ekspresji genów opisywany jest jako proces urodzin i śmierci z uwzględnieniem opóźnień. Analizowany jest głównie wpływ opóźnień na fluktuacje oraz zachowania funkcji korelacji w czasie.

W pracy D. Bratsuna i innych "Delay-induced stochastic oscillation in gene regulation" (http://www.pnas.org/content/102/41/14593.full), autorzy błędnie dopuszczali przypadek, w którym jedna cząsteczka bierze parokrotnie udział w procesie degradacji.

W publikacji "Stochastic Models of Gene Expression with Delayed Degradation" (http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11538-010-9622-4#page-1)J.Miękisz, J. Poleszczuk, M. Bodnar i U. Foryś wykluczają możliwość
wielokrotnego degradowania cząsteczki poprzez wprowadzenie dodatkowej zmiennej.

W pracach L. F Lafuerza, R. Torala "Stochastic description od delayed systems", "Role od delay in the stochastic creation process" (http://arxiv.org/abs/1105.6311, http://arxiv.org/abs/1209.4881) rozszerzono istniejące modele o opóźnioną produkcję w przypadku sprzężenia
zwrotnego.

Zostaną omówione założenia poszczególnych modeli oraz główne wnioski przedstawione w powyższych pracach.

---